الإلتهابات التي تصيب الإمعاء تنعكس بشكل كبير على الصحة النفسية وأشارت الأرقام الى أن 81% من المرضى يشعرون بالإكتئاب و91% يشعرون بالتعب والتشنج والقلق والحزن.
وأفادت الطبيبة النفسية دانييلا سيلفا مورا أن السيروتونين يتم إنتاجه في الإمعاء وهو المسؤول عن المزاج. ويشعر المريض بفقدان السيطرة. الإكتئاب هو نتيجة نفسية مهمة لإضطرابات تناول الطعام. وهذا ما يعزز نظرية أن الدماغ الثاني للإنسان موجود في جدران الإمعاء لهذا السبب هناك علاقة مباشرة بين الصحة النفسية ووظائف الجهاز الهضمي. وفي حلات القلق والتوتر يرسل إشارات منها الإنتفاخ، الإمساك، الإسهال أو الحساسية من أنواع محددة من الطعام. ويطلق العلماء على هذا الدماغ الصغير إسم ENS enteric nervous system أي الجهاز العصبي المعوي الذي يضم 100 مليون خلية عصبية.
وإضطرابات الجهاز الهضمي دليل على تراجع صحة الإمعاء وهي تؤدي الى الإمساك والإنتفاخ والحساسية من بعض أنواع الطعام. وحين تكون الإمعاء بخير تتراجع نسبة الإصابة بالإلتهابات وتأثيرها على المناعة.